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【单细胞转录组实战】十一、复现文章分析结果

手机软件开发 2024-9-3 04:36:47 83 0 来自中国

这里是佳奥！
我们进入到作者的GitHub下载一下代码来看看吧。
https://github.com/KPLab/SCS_CAF1 作者原始代码

当然，由于package的版本日新月异，除非安装相同版本的package，我就不运行了，作为学习。

2 复现文章分析结果

作者没有使用三大R包，这里我们使用之前讲到的R包来复现文章中的图。
step 1-qc

读入质控文件

主要是读取作者RNA-seq上游分析的一些结果找出离群的那些细胞。