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【GEO数据库挖掘】一、了解GEO数据库及数据下载

手机软件开发 2024-9-29 02:22:51 104 0 来自中国

找出文章GSE号，修改后缀即可。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE24673使用RStudio小tips：新建文件夹拷贝project文件可以在R中快速定位文件夹位置。很方便。
1 下载原始数据RAW.tar。

（并不推荐）

RAW.tar使用affymetix包处理。不同数据库使用的R包也不一样。
2 下载表达矩阵Matrix。

（推荐）

使用函数读取：