Xena - TCGA数据下载

手机软件开发 · 2024-9-15 02:29:45

1，Xena官网
欣赏器中输入网址 http://xena.ucsc.edu/ ，下拉找到Explore TCGA, GDC, and other public cancer genomics resources，点击

2，选择数据集
下拉选择须要的队列，此处以BRCA为例

3.检察数据
点击 GDC TCGA Breast Cancer (BRCA) ，进入BRCA数据集，检察有哪些数据

4.下载所需数据
选择对应的文件链接，点击即可。此处以点击 HTSeq - Counts 为例

留意
此数据为count数是log转化后的，须要的时间可以自行转为count数。
记得下载probeMap，探针表明文件。
涉及预后及生存相干分析，记得下载 survival data 。

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