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【块】生信上游-3 fastp

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藏宝库编辑 2024-9-1 01:16:13 61 0 来自 中国

  • 这一篇只是fastp的官方manual，背面再放实操。
1. 紧张功能


  • 质量检测
  • 扫除质量较差的reads
  • 剪掉质量低的碱基片段
  • reads首尾剪切
  • 校正低质量碱基
  • polyG、polyX剪切
  • UMI转化为序列名
  • 将效果输出为多个文件，方便后续多线程分析
  • 支持STDIN/STDOUT的管道操纵
  • reads去重
  • HTML/JSON输出效果，便于展示及鄙俚处置惩罚
2. 使用实例

紧张区分单末了还是双末了

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