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转录组丨limma差异表达分析，绘制火山图和热图

藏宝库编辑 2024-10-11 14:37:47 3770 0 来自 中国
limma差异表达分析

本篇条记的内容是在R语言中使用limma包举行差异表达分析，主要针对转录组测序得到的基因表达数据举行鄙俚分析，并将分析结果可视化，绘制火山图和热图
[TOC]
基因表达差异分析是我们做转录组最关键根本的一步，不管哪种差异分析，其本质都是广义线性模子，limma也是广义线性模子的一种，其对每个gene的表达量拟合一个线性方程。
limma包是2015年发表在Nucleic Acids Resarch一个做差异分析的工具，现在引用次数高达七千多次，最流行的差异分析软件之一就是limma。
情况部署与安装


  • 安装limma包

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