ProjecTILs系列教程(七):在线网站

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源代码 2024-9-29 22:09:11 131 0 来自 中国
前言

生信宝库在之前推出了一系列文章,分别对ProjecTILs从团体框架、代码实操、案例应用等角度举行全面解读。考虑到大多部门小同伴是不会R语言的,因此在这期推文中,Immugent将会先容ProjecTILs软件的在线网站版。
网址在:https://spica.unil.ch.
通过在线工具,各人可以直接将本身的单细胞数据传到网站上举行直接解释,而且解释的结果还可以下载下来举行后续的作图。不外必要留意的是必要根据本身的模子选择符合的参考图谱,如许解释的结果才比力正确。
紧张内容

第一幅图就是先容这个网站构建的流程。
接下来的这幅图就是通过实例展示怎样使用SPICA对肿瘤模子的单细胞数据举行解释。
末了一幅图就是通过实例展示怎样使用SPICA对小鼠感染模子的单细胞数据举行解释。
全文统共3副图,再简朴不外的文章了,也没有多少深入解读的代价,但是没有编程本领的小同伴可以通过这篇文章学习怎样使用这个网站对本身的单细胞数据举行解释。
预测

这篇文章很好的向我们展示了怎样做一份工作来发表两篇高分SCI的本领,而且这两篇研究都是通过数据发掘完成的,本身实行室没有花一分钱。从最开始发表的那篇Nature communications(ProjecTILs:一站式办理肿瘤和感染模子中T细胞的解释)到本日解读的这篇核酸,不到半年时间。总结一下,其实紧张就是两点:1.起首要具备体系的理论知识,着手办理详细的科学题目!2.在线网站的立意要新,别人没做过的,大概功能比现有的要好的。本身测的数据固然是最好,但是现在市面上有很多已经发表的公共数据,这些都可以直接使用,特殊是当本身测的数据大概还没有已经发表的数据好时,数据再使用是很关键的。
好啦,制止到如今生信宝库对ProjecTILs软件的先容已经全部结束,假如小同伴们有本身常用的比力好的软件,可以通事背景与我们接洽。
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