R中举行parallel并行运算

源代码 · 2024-10-7 21:23:18

R语言的内置并行包parallel，可以举行多线程调用。其利用方法雷同于apply家属函数，常用parApply parLapply parSaplly等函数，利用方法如下：

library(parallel) #并行盘算常用parApply parLapply parSaplly
detectCores() #检测盘算机焦点数
cl <- makeCluster(16) #指定调用的焦点数
efflen <- parLapply(cl,exon_bygeneid,function(x){
tmp <- apply(x,1,function(y){ y[1]:y[2] }) #输出exon长度值全部元素
length(unique(unlist(tmp))) #去重复并统计exon长度元素的数量
})
#stopCluster(cl) #克制多核盘算功能
#要注意利用时par内不能再嵌套par

R中举行parallel并行运算

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