WGCNA分析 | 全流程代码分享 | 代码三

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计算机软件开发 2024-9-24 20:53:38 42 0 来自 中国
关于WGCNA的分析,共有3期教程,本日是的第三期。前面两期是使用代码举行分析的,也是我们的寻常最常用的分析方法,对我个人来说也是最简便的方法。(PS:对于使用代码分析,个人有个人的见解。假如你看得懂代码,那么好坏常方便的;但是,一旦你遇到超出你本领范围的代码,就必要你得到别人的资助)
WGCNA分析教程一

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[WGCNA分析教程二]((https://mp.weixin.qq.com/s/Ln9TP74nzWhtvt7obaMp1A)

我们的前面两个教程是付费教程,对于这个代价是否值得,就是仁者见仁,智者见智。
上面的教程,全部代码都原封不动的附上,只需改动几个参数就可以;假如,你连必要改那几个参数都不知道,那么请看我每个教程的视频分析;那么,仍旧不知道,我们也没办法了
本日的教程是来自TBtools | 零基础把握WGCNA共表达网络分析 - 「WGCNAshiny by Warlock」,作者已经提供了详细的使用教程,也好坏常方便的。直接按照作者的利用分析即可。你思量的题目,作者大佬都给你思量到了!!
详细请本身详细看一下。

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作者代码存放位置:在GitHub中(https://github.com/ShawnWx2019/WGCNA-shinyApp)
本身使用作者教程安装时遇到的题目

我们在TBtools使用WGCNA shiny插件,启动后会举行安装干系的包,但是大概我的环境题目,不停安装不上,出现报错的环境。


当你遇到如许的环境,我们最好的办理办法就是直接使用作者的代码在Rstudio中的运行即可,运行乐成后直接跳出可视化利用框。
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运行乐成后的界面


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那么后的利用就按作者的教程举行即可TBtools | 零基础把握WGCNA共表达网络分析 - 「WGCNAshiny by Warlock」,但是,许多的利用还是必要本身来探索。
前面WGNCA的教程:
WGCNA分析 | 全流程分析代码 | 代码一
WGCNA分析 | 全流程分析代码 | 代码二
小杜的生信筆記 ,重要发表或收录生物信息学的教程,以及基于R的分析和可视化(包罗数据分析,图形绘制等);分享感爱好的文献和学习资料!!
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