单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》2.2CellChat多组别分析

手机软件开发 · 2024-10-7 19:57:41

媒介
在前面的一讲内容里(单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》2.1CellChat底子分析教程)我们已经给各人先容了CellChat单样本数据处理处罚的实操。本讲的内容重要向各人展示怎样挖掘细胞通讯在差别组别中的差别。本次课程所涉及的代码、测试文件在公众号背景中复兴“CellChat多组别分析”获取。后续的代码假如不出不测都会在西柚云服务器中演示（做生信，假如你还在为电脑配置而烦恼。网址：西柚云生信共享服务器）。

视频教程
单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》2.2CellChat多组别分析

往期回首
假如你还没学完底子课程，肯定要跟着下面蓝色超链接的顺序走，每篇文章中的超链接要点开看（按顺序把握自然没有疑问）：
B站视频，先看一遍视频再去看推送操纵，发起至少看三遍：
保姆级教程《手把手教你做单细胞测序数据分析》
单细胞测序底子数据分析保姆级教程，代码部门整理在往期推送之中：
手把手教你做单细胞测序数据分析（一）——绪论
手把手教你做单细胞测序数据分析（二）——各类输入文件读取
手把手教你做单细胞测序数据分析（三）——单样天职析
手把手教你做单细胞测序数据分析（四）——多样本整合
手把手教你做单细胞测序数据分析（五）——细胞范例解释
手把手教你做单细胞测序数据分析（六）——组间差别分析及可视化
手把手教你做单细胞测序数据分析（七）——基因集富集分析
上游fastq文件处理处罚：
单细胞分析的最上游——处理处罚Fastq文件：cellranger
单细胞分析的最上游——处理处罚Fastq文件：dropseqRunner
细胞通讯
B站一连播放起来比力方便：
https://www.bilibili.com/video/BV1Ab4y1W7qx?p=1
往期推送
单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》1.概论
单细胞测序数据进阶分析—《细胞通讯》2.1CellChat底子分析教程
其他单细胞干系技能贴也在这里：
细胞的数目由誰决定？
单细胞中应该怎样做GSVA？
答读者问（三）：单细胞测序远景
答读者问（四）：怎样分析细胞亚群
答读者问（六）：Seurat中怎样让细胞听你指挥
答读者问（八）：为什么Read10X也会报错?
答读者问（十）整合后的表达矩阵，怎样拆分出分组信息？
答读者问（十一）怎样一次性读取一个目次下的cellranger输出文件？
单细胞文献阅读：
文献阅读系列（八）、不会吧不会吧，Nature都能白嫖？
文献阅读系列（十一）、高氧下小鼠肺发育损伤的ScRNA图谱
文献阅读系列（十二）、IgAN & STRT-Seq
非技能帖：
关于单细胞的事谈谈背面的筹划
Biomamba助推的第一篇论文发表啦

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